Владимир Нахабцев родился 16 июля 1938 года на подмосковной станции Болшево (ныне в черте города Королёв). Окончил операторский факультет ВГИКа (1961, мастерская А. В. Гальперина). По окончании ВГИКа работал вторым оператором на съёмках картины «Гусарская баллада» Э. А. Рязанова. Следующий фильм Рязанова, «Дайте жалобную книгу», Нахабцев снимал уже в качестве оператора-постановщика (совместно с Анатолием Мукасеем). Всего Владимир Нахабцев снял семь картин Эльдара Рязанова, в том числе «Ирония судьбы, или С лёгким паром!» (Государственная премия СССР) и «Служебный роман» (Государственная премия РСФСР имени братьев Васильевых). Также снимал фильмы с режиссёрами: А. И. Суриковой, Э. В. Лотяну, М. А. Захаровым, А. Н. Миттой, Е. И. Ташковым, И. Ш. Фридбергом.
Преподавал во ВГИКе. В 1981 году избирался секретарем правления СК СССР.
В. Д. Нахабцев умер 10 марта 2002 года. Похоронен на Троекуровском кладбище.
